قبل از تشکیل این سازمان، از بدو پیروزی انقلاب فقط دو مرکز آموزشی تیز هوش فقط در تهران وجود داشت که تحتپوشش دفتر کودکان استثنایی فعالیت مینمود و در سال 66 جمعا802 دانش آموز داشت(این دو مرکز فرزانگان و علامه حلی تهران بودند) که هر لحظه امکان انحلالو ادغام این دو مرکز در مراکز عادی نیز وجود داشت....
هیئت امناء این سازمان در سال 1366 با درخواست معاون فرهنگی - اجتماعی نخست وزیرو آقای دکتر جواد اژهای با حکم نخستوزیرمنصوب گردیدند. ابتدا این سازمان قرار بود صرفا زیر نظر هیئت امناء اداره شود.اعضای هیئت امنا عبارت بودند از: وزیر آموزش و پرورش، وزیر فرهنگ و آموزش عالی، رئیس سازمان پژوهشهای علمی و صنعتی، مدیرعامل صدا و سیما، معاون نخست وزیر و رئیس برنامه و بودجه، رئیس بنیاد مستضعفان و جانبازان و سه شخصیت علمی کشور آقایان دکترحسن ابراهیمحبیبی، حجتالاسلام دکتر احمد احمدی و حجت الاسلام دکتر جواد اژهای.
در طول سال تحصیلی 66 تا 67 بر اساس جمعبندی هیئت امناء سازمان به درخواست معاون فرهنگی اجتماعینخستوزیر - آقای دکتر اژهای - به نخستوزیر و با حمایت ریاست محترم جمهوری وقت و رهبر انقلاب حضرت آیت الله خامنهای، با تصویب ماده واحدهای درشورایعالی انقلاب فرهنگی جایگاه مستحکمتری سازمان پیدا نمود. بر اساس این مصوبه وزیر آموزش و پرورش رئیس هیئت امنا سازمان و آقای دکتر جواد اژهای علاوه بر عضویت علمی هیئت امنا به ریاست سازمان انتخاب گردیدند.